Az Egyesült Államok Betegségellenőrzési és Megelőzési Központja (Centers for Disease Control and Prevention, CDC) konzorciumot indított a szekvenáló laboratóriumok országos hálózatának elindítására, amely felgyorsítja a SARS-CoV-2 szekvenciaadatok nyilvánosságra hozatalát. A nyílt koronavírus-szekvencia adatok gyors közzététele segít az útmutatásban Covid-19 közegészségügyi reagálás, innováció és felfedezés ösztönzése, valamint a jelen és a jövőbeli járványok megértésének elősegítése.
Ezt SARS-CoV-2 szekvenálás közegészségügyi vészhelyzeti reagáláshoz, epidemiológiához és felügyelethez (SPHERES) konzorcium, amely nagymértékben bővíti a felhasználását teljes genom szekvenálás (WGS) a COVID-19 vírustól. A SPHERES konzisztens, valós idejű szekvenciaadatokat fog szolgáltatni a közegészségügyi reagálási csoportoknak, amelyek országszerte vizsgálják a COVID-19 eseteit és csoportjait.
Ez az új konzorcium segít nekik jobban megérteni, hogyan terjed a vírus országosan és helyi közösségeikben egyaránt. A jobb adatok pedig segítenek a közegészségügyi tisztviselőknek megszakítani az átviteli láncokat, megelőzni az új betegségeket, valamint életeket védeni és megmenteni.
„Az Egyesült Államok a világ vezető pozíciója a fejlett gyors genomszekvenálás terén. Az állami, magán-, klinikai és akadémiai közegészségügyi laboratóriumaink között ez az összehangolt erőfeszítés létfontosságú szerepet fog játszani a SARS-CoV-2 terjedésének, fejlődésének és kezelésének megértésében. Biztos vagyok benne, hogy legjobb, legképzettebb elméink együtt dolgoznak, hogy életeket mentsünk ma és holnap” – mondta Robert Redfield, a CDC igazgatója, MD.
A COVID-19 vírus nyomon követése, ahogyan az fejlődik
A genomi szekvencia adatok példátlan betekintést nyújthatnak a SARS-CoV-2, a COVID-19-et okozó vírus biológiájába, és segíthetnek meghatározni a világjárvány változó helyzetét. Az Egyesült Államokból származó vírusok szekvenálásával a CDC és más közegészségügyi hatóságok nyomon követhetik a vírusban bekövetkezett fontos változásokat, és felhasználhatják ezt az információt az érintkezés nyomon követésére, a közegészségügyi intézkedések enyhítésére és a fertőzések elleni védekezési stratégiákra.
A SPHERES konzorcium egy ambiciózus erőfeszítés a SARS-CoV-2 genomszekvenálás országos koordinálására, több tucat kisebb, egyéni erőfeszítést egyetlen, laboratóriumok, intézmények és vállalatok elosztott hálózatába szervezve. A konzorcium 40 állami és helyi közegészségügyi osztály, több nagy klinikai laboratórium és több mint két tucat együttműködő intézmény szakértelmét, technológiáját és erőforrásait egyesíti a szövetségi kormány, a tudományos élet és a magánszektorban.
A SPHERES bevált gyakorlatokat és konszenzusos adatszabványokat hoz létre, felgyorsítja a nyílt adatmegosztást, valamint erőforrás- és szakértelem bázist hoz létre, hogy a legkorszerűbb technológiát hozza a COVID-19-re adott nemzeti válaszlépésekhez.
SPHERES adat megnyitva, megosztva
A konzorcium tagjai osztoznak a gyors nyílt sorozatmegosztás mellett. Azt tervezik, hogy minden hasznos szekvenciaadatot benyújtanak az Országos Orvostudományi Könyvtár Nemzeti Biotechnológiai Információs Központjának (NLM/NCBI), a madárinfluenza adatok megosztására irányuló globális kezdeményezésnek (GISAID) és más nyilvános szekvenciatárolóknak a nyilvános adattáraiba. Ez segíteni fog abban, hogy az Egyesült Államokból származó vírusszekvencia-adatok gyorsan elérhetőek legyenek a közegészségügyi döntéshozatalhoz, és szabadon hozzáférhetők legyenek a kutatók számára mindenhol.
A konzorcium tagjai a következők:
Szövetségi ügynökségek és laboratóriumok
Betegségellenőrzési és Megelőzési Központok, Fejlett Molekuláris Detekciók Hivatala
Diffraktáltuk
Védelmi Egészségügyi Ügynökség, Globális fertőző betegség Felügyelet
Food and Drug Administration
Lawrence Berkeley Nemzeti Laboratórium
Los Alamos Nemzeti Laboratórium
Országos Allergia és Fertőző Betegségek Intézete, Genomikai és Fejlett Technológiai Hivatal
Nemzeti Szabványügyi és Technológiai Intézet
National Library of Medicine Nemzeti Biotechnológiai Információs Központ
Walter Reed Hadsereg Kutatóintézete
Állami/helyi közegészségügyi laboratóriumok
Arizona
Kalifornia
Delaware
District of Columbia
Florida
Hawaii
Maine
Maryland
Massachusetts
Michigan
Minnesota
Észak-Karolina
Észak-Dakota
Nevada
Új-Mexikó
New York
Utah
Virginia
Washington
Wisconsin
Wyoming
Tudományos intézmények
Baylor Egyetem
Cornell Egyetem
Fred Hutchinson Rákkutató Központ
Mount Sinai Orvostudományi Iskola
New York-i Egyetem
Észak-Arizona Egyetem
Buffalo Egyetem
University of California, Berkeley
Kaliforniai Egyetem, Davis
University of California, Irvine
University of California, Los Angeles
University of California, San Francisco
University of California, Santa Cruz
University of Chicago
Maryland Egyetem
University of Minnesota
Nebraska Egyetem
New Mexico Egyetem
Washington Egyetem
Yale Egyetem
Corporations
Abbott Diagnosztika
bioMerieux
Színgenomika
Gingko Bioworks
IDbyDNA
In-Q-Tel
LabCorp
Egy kódex
Oxford Nanopore Technologies
Csendes-óceáni biológiai tudományok
Qiagen
Quest Diagnostics
Valóban Élettudományok
A vállalatok nevei csak tájékoztatási célokat szolgálnak, és itt feltüntetésük nem jelenti azt, hogy az Egyesült Államok Betegségellenőrzési és Megelőzési Központja jóváhagyja a vállalatokat vagy bármely kereskedelmi terméküket vagy szolgáltatásukat.
Nonprofit közegészségügyi vagy kutatóintézetek
Népegészségügyi Laboratóriumok Szövetsége
Bill és Melinda Gates Alapítvány
Széles Intézet
Chan Zuckerberg BioHub
Craig Venter Intézet
Népegészségügyi Szövetség a Genomikus Epidemiológiáért
Scripps kutatás
A Jackson laboratórium
Translational Genomics Research Institute – Észak
Walder Alapítvány
Az elmúlt hat évben a CDC Office of Advanced Molecular Detection programja szövetségi és állami közegészségügyi laboratóriumokba fektetett be, hogy kiterjessze a kórokozó genomika és más fejlett laboratóriumi technológiák alkalmazását a fertőző betegségek felügyeletére és a járványokra való reagálásra. A jelenlegi konzorciumi beruházás célja életek megmentése a SARS-CoV-2 világjárványban, valamint az Egyesült Államok és a világ felkészítése a jövőbeli pandémiás válaszlépésekre.
Ha többet szeretne megtudni a genomikus szekvenálásról vagy a CDC-nek a fejlett molekuláris detektálásban végzett munkájáról, látogasson el ide https://www.cdc.gov/amd/
MIT KELL ELVENI A CIKKBŐL:
- Names of corporations are provided for information purposes only, and their inclusion here does not constitute an endorsement of the corporations or any of their commercial products or services by the U.
- The US Centers for Disease Control and Prevention, CDC, launched a consortium to kick off a national network of sequencing laboratories which will speed the release of SARS-CoV-2 sequence data into the public domain.
- A SPHERES bevált gyakorlatokat és konszenzusos adatszabványokat hoz létre, felgyorsítja a nyílt adatmegosztást, valamint erőforrás- és szakértelem bázist hoz létre, hogy a legkorszerűbb technológiát hozza a COVID-19-re adott nemzeti válaszlépésekhez.
